Dans une casserole, faire fondre le beurre à feu moyen.
Ajouter la farine et mélanger pour obtenir un roux.
Faire cuire le roux pendant 2 minutes en remuant constamment.
Verser le lait de cuisson du chou-fleur en filet sur le roux, tout en continuant de mélanger.
Porter à ébullition tout en continuant de remuer pour éviter la formation de grumeaux.
Réduire le feu et laisser cuire la sauce béchamel pendant encore quelques minutes, en remuant de temps en temps, jusqu'à ce qu'elle épaississe.
Râper l'emmental, puis en incorporer une partie à la sauce béchamel (en réserver une portion pour le gratin).
Mélanger jusqu'à ce que le fromage soit bien fondu.
Assaisonner la sauce avec du sel et de la noix de muscade râpée.